Hi,
ich gehe mal davon aus, dass du bereits überprüft, ob nicht tatsächlich ein (defektes?) USB Gerät das verursacht. Im Zweifel mal alle möglichen USB Geräte abklemmen. Insbesondere ein Handheld/Palm etc. könnte bei der Synchronisation das von dir beschriebene Phänomen verursachen.
Ist das alles ausgeschlossen, würde ich dir zum Process Explorer raten. Der PE ist ein Tool in der Art des Taskmanager, nur viel umfangreicher. Weitere Infos und Download gibts hier:
Process Explorer
Lass den PE im Hintergrund mitlaufen und wenn das System wieder hakt, kannst du dir anschauen welcher Process deine Resourcen frisst.
Mit diesen Infos wirst du dem "Täter auf die Spur" kommen.
Gruß
Anno
Rückmeldung wäre nett.