Hallo Basti5,
in XP selbst kann man über die Registry nur beeinflussen was in diesen Ordner geschrieben wird, der Ordner selbst wird dabei aber nicht gelöscht. Es handelt sich hier also nicht um das Standard-Verhalten von XP, du musst das ständige Löschen des Prefetch-Ordners selbst eingerichtet haben.
Da nichts über den von dir dazu verwendeten Weg bekannt ist müsstest du mal deine Erinnerungen durchforsten um das selbst wieder rückgängig machen zu können. Ich tippe mal darauf, dass du irgend ein s.g. 'Tuning-Tool' im Einsatz hast und dort einen Haken entfernen musst, damit der Ordner beim Beenden von XP nicht mehr gelöscht wird.
Gruß
Kalle