Moin Arty,
solche Ausfälle gibt es bei mir auch, allerdings habe ich das nur bei Clips bemerkt, bei denen das Real Time Messaging Protocol (RTMP) zum Einsatz kommt (URL beginnt mit "rtmp://"). Bei KIKA ist das z.B. generell der Fall, bei anderen Sendern nur gelegentlich.
Diese Clips sind ausschließlich zum Abspielen über ein Flash-Plugin des Browsers bestimmt und lassen sich deshalb nicht direkt an den VLC Player übergeben. MediathekView schaltet hier das Hilfsprogramm "flvstreamer" dazwischen, welcher den Stream dann an den VLC Player zur Anzeige weitergibt.
Warum das meistens klappt, bei machen FLV-Streams aber nicht, kann ich dir leider auch nicht sagen. Irgendwelche offensichtlichen Unterschiede konnte ich jedenfalls nicht feststellen.
Gruß
Kalle